Dalam rangka meningkatkan efisiensi, efektivitas, transparansi dan akuntabilitas penyelenggaraan pemerintahan Bappeda Kota Yogyakarta menetapkan Standar Operasional Prosedur untuk beberapa hal, antara lain :

  1. SOP Koordinasi Perencanaan Pembangunan Sub Bidang Pendidikan
  2. SOP Monitoring dan Evaluasi Pelaksanaan Rencana Pembangunan Pada Sub Bidang Pengendalian Program
  3. SOP Pelaporan Dana Alokasi Khusus, Dana Keistimewaan dan Bantuan Keuangan Khusus
  4. SOP Koordinasi Perencanaan Sub Bidang SDA, Lingkungan Hidup dan Tata Ruang
  5. SOP Koordinasi Perencanaan Pengendalian Sub Bidang Kesejahteraan rakyat
  6. SOP Metadata Sasaran Daerah
  7. SOP Monitoring dan Evaluasi Inovasi Perangkat Daerah
  8. SOP Monitoring, Evaluasi dan Penyusunan Laporan Berkala Pelaksanaan Pembangunan Daerah
  9. SOP Pembaruan Basis Data Pengelolaan Data Tunggal Sasaran Intervensi Berbasis Elektronik
  10. SOP Pengusulan Dana Alokasi Khusus Fisik Kota Yogyakarta
  11. SOP Pengusulan Sasaran dalam Pengelolaan Data Tunggal Sasaran Intervensi Berbasis Elektronik
  12. SOP Penyusunan Rencana Kerja Pemerintah Daerah
  13. SOP Penyusunan Informasi Program dan Kegiatan Pembangunan APBD Perubahan dan Rencana Program dan Kegiatan Pembangunan APBD Murni
  14. SOP Penyusunan Laporan Kinerja (LKIP) Kota Yogyakarta
  15. SOP Koordinasi Perencanaan Pengendalian Sub Bidang Pemerintahan